量的舰娘，并依靠她们，在短短的一百年间，几乎消灭了所有的百海皇，连带着将人类从海兽的绝望中，解救了出来。
在这个时代，人类只知道舰娘的敌人是深海，却不知道，早在三百多年前，深海根本就不存在，人类唯一的敌人，是这些可怕的海兽与污染种。
所以，亚世界是神秘而不可知的，那里究竟是个什么样的世界，大家也只能猜测，只不过，随着一批特殊舰娘的苏醒，人类得到了模棱两可的答案。没错，那些舰娘，就是如同岛风、响、安德烈这样的，从亚世界活下来，并随着1300年前亚世界之门的开启，来到这个世界的舰娘。
她们中的部分成员，告诉海军与政府，亚世界，是一个巨大的骗局，有人，创造了那个世界，就像圈养一般，将人类圈养在了那个世界里，长达六千多年。
通水，也从亚世界的舰娘们的口中，政府得知了一个新的世界————原型世界！
原型舰娘，的确存在，但是无比稀少。
亚世界的舰娘们告诉了这个世界的人，一个神话，她们说，当大海被阴影笼罩，洪流的风暴将席卷整个世界，这是神的审判，它要清理掉大地上所有的生灵，一个不留，而在这场风暴中，人类唯一的希望，就是方舟。