间最好成绩为1991年首次进入国王杯的决赛。19971998是其战绩最好时期，在总教练埃克多尔·库佩尔的带领下，获得了国王杯的亚军，此后又战胜巴塞罗那队，赢得了西班牙超级杯。。 1999年再创佳绩，在欧洲优胜者杯上获亚军。至于西甲联赛，其历史最好成绩为第三名，只输给巴塞罗那队和皇家马德里队。2000年，该队被足球历史及统计联合会评为99年度世界第八强球队。
进入21世纪后，马洛卡的成绩一直都处于中游。但在2004/05赛季马洛卡走进了低谷，至冬歇期时几乎已经被认定肯定降级。俱乐部重新聘请著名教练库珀出山，才创造了最后一轮保级的奇迹。
上个赛季最后阶段，西甲两大巨头皇马和巴萨争夺联赛冠军，为了鼓励马洛卡在最后一轮阻击皇马夺冠，巴塞罗那甚至开出了第三方奖金，但是马洛卡上赛季最后一轮输给皇家马德里，马洛卡损失的来自巴塞罗那方面的各种奖励至少超过400万欧元，也让球队失去了在夏季转会市场有所的动作的资金。但球队主帅曼萨诺却想俱乐部董事会承诺，他有信心在没有重要签约的前提下完成新赛季的保级重任，甚至希望带领球队进入下赛季的欧洲赛场。马洛卡是赛季前不多的保持热身赛不败的